留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

实时荧光重组酶聚合酶扩增在白色念珠菌检测中的初步应用

蒙雨丹 刘爽 赵军宁 彭毅志 苏丹 金晓君 李晓鲁

蒙雨丹, 刘爽, 赵军宁, 等. 实时荧光重组酶聚合酶扩增在白色念珠菌检测中的初步应用[J]. 中华烧伤杂志, 2019, 35(8): 587-594. Doi: 10.3760/cma.j.issn.1009-2587.2019.08.006
引用本文: 蒙雨丹, 刘爽, 赵军宁, 等. 实时荧光重组酶聚合酶扩增在白色念珠菌检测中的初步应用[J]. 中华烧伤杂志, 2019, 35(8): 587-594. Doi: 10.3760/cma.j.issn.1009-2587.2019.08.006
Meng Yudan, Liu Shuang, Zhao Junning, et al. Preliminary application of real-time fluorescence recombinase polymerase amplification in Candida albicans[J]. Chin j Burns, 2019, 35(8): 587-594. Doi: 10.3760/cma.j.issn.1009-2587.2019.08.006
Citation: Meng Yudan, Liu Shuang, Zhao Junning, et al. Preliminary application of real-time fluorescence recombinase polymerase amplification in Candida albicans[J]. Chin j Burns, 2019, 35(8): 587-594. Doi: 10.3760/cma.j.issn.1009-2587.2019.08.006

实时荧光重组酶聚合酶扩增在白色念珠菌检测中的初步应用

doi: 10.3760/cma.j.issn.1009-2587.2019.08.006
基金项目: 

西南医院重大领域技术创新计划重点项目 (SWH2016ZDCX2001)

国家自然科学基金 (81571896、81772073)

四川省中医药管理局中医药科学技术研究专项 (2015Z006)

西南医院军事医学与战创伤救治临床新技术计划 (SWH2016YSCXYB-10)

Preliminary application of real-time fluorescence recombinase polymerase amplification in Candida albicans

  • 摘要: 目的 探讨实时荧光重组酶聚合酶扩增(RPA)在白色念珠菌检测中的初步应用效果。 方法 (1)取1 mL白色念珠菌标准株及阴性对照菌铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、鲍氏不动杆菌、大肠杆菌、光滑念珠菌标准株菌液,使用酵母/细菌基因组试剂盒提取DNA。分析PCR、实时荧光定量PCR、实时荧光RPA检测白色念珠菌的特异性。(2)取1株白色念珠菌标准株,以光滑念珠菌为阴性对照菌,复苏摇菌并计数,10倍倍比稀释为1×107 ~1×101集落形成单位(CFU)/mL,同实验(1)提取DNA,分析PCR、实时荧光定量PCR、实时荧光RPA检测白色念珠球菌的灵敏性。统计实时荧光定量PCR扩增曲线达到阈值所需循环数及实时荧光RPA出现特异性扩增曲线所需时间,并与PCR结果进行比对。统计3种方法对白色念珠菌的检出下限及检出率,分析实时荧光RPA中白色念珠菌浓度与检测时间之间的相关性。(3)取1株白色念珠菌标准株,同实验(1)提取DNA,分别行PCR、实时荧光定量PCR、实时荧光RPA,统计3种方法检测总时长。(4)取31份疑似感染白色念珠菌的临床样本和1份棉拭子取材的白色念珠菌临床样本提取DNA,进行PCR与实时荧光RPA,统计阳性检出率。分别采用酵母/细菌基因组试剂盒、chelex-100加热煮沸法、液氮反复冻融法提取上述2种方法检测均出现阳性结果的临床样本的DNA。同前行实时荧光RPA检测(以光滑念珠菌为阴性对照菌)和PCR检测,阴性对照菌同实验(1),观察2种方法检测是否出现阳性结果,并统计实时荧光RPA中扩增曲线达到荧光阈值所需时间。对数据行线性相关分析和t检验。 结果 (1)3种方法检测中白色念珠菌均出现阳性结果,5种阴性对照菌均未出现阳性结果。(2)白色念珠菌菌液浓度越低,实时荧光定量PCR中扩增曲线达到阈值所需循环数越多,实时荧光RPA中出现特异性扩增曲线所需时间越长,PCR中凝胶条带的亮度越弱,3种检测方法中阴性对照菌均未出现相应的阳性结果。实时荧光RPA、PCR与实时荧光定量PCR中白色念珠菌的检出下限均为1×101 CFU/mL。实时荧光RPA中白色念珠菌浓度与检测时间呈明显负相关,r=-0.95,P<0.01。PCR与实时荧光定量PCR对1×101~1×107 CFU/mL的白色念珠菌的阳性检出率均为100%。实时荧光RPA对1×101 CFU/mL的白色念珠菌的阳性检出率为78%,对1×102 ~1×107 CFU/mL的白色念珠菌的阳性检出率均为100%。(3)PCR、实时荧光定量PCR、实时荧光RPA检测白色念珠菌的总时间分别为133、93、35 min。(4)实时荧光RPA对31份疑似感染白色念珠菌临床样本的阳性检出率为32.26%(10/31),低于PCR的35.48%(11/31)。11份临床样本经实时荧光RPA与PCR检测均出现阳性结果,阴性对照菌均未出现阳性结果。采用酵母/细菌基因组提取试剂盒、chelex-100加热煮沸法提取DNA进行实时荧光RPA,扩增曲线达到阈值所需时间分别为(438±13)、(462±12)s,二者相近(t=1.32,P>0.05)。液氮反复冻融法提取DNA进行实时荧光RPA,扩增曲线达到阈值所需时间为(584±15)s,明显长于另外2种方法(t=7.55、6.39,P<0.01)。 结论 实时荧光RPA检测白色念珠菌具有检测快速、操作简单、灵敏性高、特异性好等优点,值得临床推广应用。

     

  • 加载中
计量
  • 文章访问数:  111
  • HTML全文浏览量:  5
  • PDF下载量:  7
  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2019-03-18
  • 网络出版日期:  2021-10-28
  • 刊出日期:  2019-08-20

目录

    /

    返回文章
    返回